Science ouverte - Université de Strasbourg https://scienceouverte.unistra.fr fr Science ouverte - Université de Strasbourg Thu, 21 Nov 2024 10:55:38 +0100 Thu, 21 Nov 2024 10:55:38 +0100 TYPO3 EXT:news news-12424 Tue, 28 Jan 2025 14:45:00 +0100 Workshop on Research Data Management /actualites/actualite/workshop-on-research-data-management-28-01-2025 The Karlsruhe Institute of Technology offers an in-person workshop for doctoral students from Eucor universities, providing guidance on managing research data from project planning to archiving and reuse. The workshop includes specific introductions to the research infrastructures "Kadi4Mat Platform," "Chemotion Electronic Lab Notebook," and "Karlsruhe Nano-Micro Facility," with hands-on training on their use.


•  Introduction to Research Data Management application Kadi4Mat:

  1. Getting to Know the Kadi4Mat Platform
  2. Hands-on Practice
  3. Data Publication and Sharing

•  Introduction on Chemotion Electronic Lab Notebook for Chemistry

  1. The Chemotion system allows the transfer of data into a repository for research data including the generation of DOIs as persistent identifier.

•  Introduction on Karlsruhe Nano-Micro Facility and its methods

  1. Transmission Electron Microscopy (TEM)
  2. Atomic Force Microscopy (AFM)
  3. Direct Laser Writing (DLW)
  4. 3D Printing (3DP)

Format: 28./29. January 2025  1,5 day in person training at KIT (Campus South)

Registration: Register online filling this form

Participants: The Karlsruhe Institute of Technology offers an in-person workshop for doctoral students from Eucor universities

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Agenda des formations Science ouverte
news-9976 Tue, 10 Dec 2024 10:00:00 +0100 Déposer un jeu de données /actualites/actualite/deposer-un-jeu-de-donnees Participez aux classes virtuelles de Recherche Data Gouv

Cette classe virtuelle permet de comprendre comment déposer un jeu de données dans l’entrepôt. Cette séance aborde les points suivants :

  • Présentation de Recherche Data Gouv
  • Concepts clés
  • Utilisation de l’entrepôt

Public : toute personne pouvant être amenée à utiliser l’entrepôt Recherche Data Gouv.

Support : Déposer des données dans l'entrepôt Recherche Data Gouv

Intervenants:

Equipe plateforme Recherche Data Gouv

Rappel : il n'est pas nécessaire de s'inscrire, il suffit de rejoindre la session souhaitée en temps et en heure en cliquant sur le lien suivant : https://bbb.visio.inrae.fr/b/cla-iui-rpi-mtg

Contact: en local à l'Université de Strasbourg: Recherche Data Gouv:

support-entrepot[at]unistra.fr

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news-12426 Mon, 09 Dec 2024 13:47:00 +0100 Semaine Data-SHS Strasbourg /actualites/actualite/semaine-data-shs-strasbourg-09-12-2024 Pour la sixième année consécutive la Plateforme Universitaire de Données de Strasbourg (PUD-S) organise 5 jours de communications et d’ateliers consacrés à l’utilisation de données quantitatives en sciences humaines et sociales (SHS). Pour la sixième année consécutive la Plateforme Universitaire de Données de Strasbourg (PUD-S) organise 5 jours de communications et d’ateliers consacrés à l’utilisation de données quantitatives en sciences humaines et sociales (SHS).

Cette semaine est organisée au niveau national par la très grande infrastructure de recherche Progedo et le Réseau National des Maisons des Sciences de l’Homme.

Cette sixième édition fera la part belle aux ateliers pratiques et à la mise en avant des données d’enquêtes produites par la statistique publique. Intervenantes extérieures et personnels de la plateforme assureront chacune des sessions composant le programme de la semaine.

Lundi 09 décembre 2024

Matin : Introduction au langage R : première partie

Après-midi : Introduction au langage R : seconde partie

Mardi 10 décembre 2024

  • Matin : Exploiter des données d’enquête : première partie
  • Après-midi : Exploiter des données d’enquête : seconde partie

Mercredi 11 décembre 2024

  • Après-midi : La vie sexuelle et affective des jeunes adultes

« Couples, histoires d’un soir et sexfriends. Enquêter sur la diversité relationnelle des jeunes » par M.Bergström (INED) et C.Hemmer (INED)

Jeudi 12 décembre 2024

  • Matin : Quelles représentations graphiques pour mes données ?
  • Après-midi : Reproduction de graphiques d’une publication scientifique

Vendredi 13 décembre 2023

  • Matin : Introduction à LimeSurvey, première partie
  • Après-midi : Introduction à LimeSurvey, seconde partie

Plus d’informations sont disponibles dans le programme détaillé disponible à l’adresse suivante.

S’inscrire aux événements

Contact: pud-s[at]misha.fr

 

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news-9624 Wed, 20 Nov 2024 11:05:00 +0100 Python /actualites/actualite/python-20-11-2024 Utiliser le langage de programmation Python Public:

Personnel de l'Université de Strasbourg et des établissements partenaires (contrat de site alsacien: UHA, INSA, BNU, ENSAS, ENGEES et Hear), confronté à l’utilisation d’un langage de programmation, désirant s’initier plus particulièrement au langage Python.

Prérequis:

La connaissance préalable d’un langage de programmation facilitera l’apprentissage mais n’est pas obligatoire. Les participants devront venir avec un PC portable pouvant se connecter au wifi. Il serait fort appréciable d’avoir au préalable installé Python, Jupyter Notebook et l’environnement de développement Spyder afin de rentrer directement dans le vif du sujet.


Objectifs:

  • Être capable de créer et manipuler des données, de gérer la logique de programmation.

Contenu:
Lors de cette formation initiale sur deux jours, nous aborderons les fondamentaux du langage :

  1. variable
  2. type de données
  3. opérateurs
  4. structures de contrôles
  5. fonctions
  6. bonnes pratiques de développement

Les connaissances acquises seront appliquées dans le cadre d’un microprojet.

 

Intervenante: Mary Mondino (ICube)

Inscription: gratuite pour les personnels concernés, sur inscription obligatoire via le service formation des personnels de votre établissement.

Contact: DRH-formation[at]unistra.fr

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Agenda des formations Science ouverte
news-10000 Fri, 15 Nov 2024 09:30:00 +0100 Introduction à la science ouverte /actualites/actualite/introduction-a-la-science-ouverte-15-11-2024 De l'open data à l'open research data

Objectifs

  • Se familiariser avec les concepts de base de la science ouverte
  • Connaître le cadre institutionnel européen et français de la science ouverte
  • Etre informé des débats et questions soulevés par la science ouverte

Programme

  1. Définition et enjeux de la science ouverte
  2. Historique : de l'open data  à l'open research data
  3. Politiques européennes et nationales en science ouverte
  4. Idées reçues et débats autour de la science ouverte

 

Intervenant: 

Noël Thiboud, responsable de l'URFIST de Strasbourg

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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Agenda des formations Science ouverte
news-9975 Thu, 14 Nov 2024 10:00:00 +0100 Déposer un jeu de données /actualites/actualite/deposer-un-jeu-de-donnees-14-11-2024 Participez aux classes virtuelles de Recherche Data Gouv

Cette classe virtuelle permet de comprendre comment déposer un jeu de données dans l’entrepôt. Cette séance aborde les points suivants :

  • Présentation de Recherche Data Gouv
  • Concepts clés
  • Utilisation de l’entrepôt

Public : toute personne pouvant être amenée à utiliser l’entrepôt Recherche Data Gouv.

Support : Déposer des données dans l'entrepôt Recherche Data Gouv

Intervenants:

Equipe plateforme Recherche Data Gouv

Rappel : il n'est pas nécessaire de s'inscrire, il suffit de rejoindre la session souhaitée en temps et en heure en cliquant sur le lien suivant : https://bbb.visio.inrae.fr/b/cla-iui-rpi-mtg

Contact: en local à l'Université de Strasbourg: Recherche Data Gouv:

support-entrepot[at]unistra.fr

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news-9999 Wed, 13 Nov 2024 14:00:00 +0100 Quelle place pour votre institution sur Wikipédia ? /actualites/actualite/quelle-place-pour-votre-institution-sur-wikipedia-13-11-2024 Comment votre institution/laboratoire/département/école doctorale peut utiliser Wikipédia pour améliorer sa visibilité et partager ses ressources Cette formation traitera de la place des institutions sur Wikipédia et vous offrira des conseils pratiques pour rejoindre la communauté des contributeurs et contributrices.

Vous découvrirez comment votre institution peut utiliser Wikipédia pour améliorer sa visibilité et partager ses ressources. La formation abordera les bonnes pratiques pour créer et éditer des articles en respectant les règles de neutralité, de vérifiabilité et de notabilité de Wikipédia. Elle vous donnera des conseils sur la contribution, la gestion et la déclaration des conflits d'intérêts et l'engagement avec la communauté Wikipédia.

À l'issue de cette séance, vous serez équipés pour intégrer efficacement votre institution dans l'écosystème Wikipédia et contribuer de manière éthique et productive.

Aucun prérequis.

Intervenant: 

Mickaël Schauli, wikimédien en résidence à l'URFIST de Strasbourg

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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news-9992 Wed, 13 Nov 2024 13:30:00 +0100 Initiation à la manipulation de données avec Pandas, à travers les données de la Bnu /actualites/actualite/initiation-a-la-manipulation-de-donnees-avec-pandas-a-travers-les-donnees-de-la-bnu-13-11-2024

Compétences visées :

  •  Savoir utiliser un notebook basique
  •  Comprendre ce qu'est une librairie python
  •  Avoir une vue d'ensemble de la chaîne de l'analyse des données (les récupérer, les lire, les nettoyer, les décrire, les visualiser)
  • Comprendre l'intérêt de pandas pour étudier un jeu de données tabulaire
  •  Découvrir les fonctionnalités de base de pandas

Intervenante  : Elisa Michelet, lab manageuse, Lab de la Bibliothèque Nationale Universitaire de Strasbourg

Pour la séance merci d'amener votre propre ordinateur.

Programme

En utilisant des données rendues accessibles à toutes et tous par la Bnu, plongez dans l'univers de la manipulation de données grâce à Pandas, et comprenez les enjeux de l'utilisation de notebooks dans le cadre de la science ouverte.

Pandas est un outil de manipulation et d'analyse des données rapide, puissant, flexible, facile à utiliser et open source.

L'atelier est court, pensé pour des personnes n'ayant aucune expérience en programmation :vous aurez l'occasion d'apprendre, en douceur, à manipuler et visualiser des données Excel de base avec Python et la librairie Pandas.

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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news-9991 Tue, 12 Nov 2024 14:00:00 +0100 Valoriser ses images et ses recherches sur Wikimédia Commons /actualites/actualite/valoriser-ses-images-et-ses-recherches-sur-wikimedia-commons-12-11-2024 S'initier à Wikimedia Commons, la médiathèque libre et collaborative de Wikimedia. Cette formation a pour but de vous initier à Wikimedia Commons, la médiathèque libre et collaborative de Wikimedia.

Vous découvrirez comment téléverser et gérer des fichiers multimédias (images, vidéos, sons) sur la plateforme. La formation couvrira les aspects techniques du téléversement, ainsi que les bonnes pratiques en matière de droits d'auteur et de licences libres. Vous apprendrez également à catégoriser et décrire correctement vos fichiers pour maximiser leur utilité et visibilité.

À l'issue de cette séance, vous serez prêt·es à enrichir Wikimedia Commons avec des contributions de qualité, tout en respectant les règles et les standards de la communauté.

Aucun prérequis.

Intervenant: 

Mickaël Schauli, wikimédien en résidence à l'URFIST de Strasbourg

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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news-9988 Thu, 07 Nov 2024 14:00:00 +0100 Zotero avancé /actualites/actualite/zotero-avance-07-11-2024 Découvrir et savoir utiliser les fonctions avancées de Zotero.

Cette séance permet à des personnes utilisant déjà régulièrement  Zotero  d'optimiser leur travail avec ce logiciel.

Pré-requis : Savoir utiliser les fonctions de base du logiciel (Importation de références, citation dans un traitement de texte) ou avoir suivi une formation d'initiation à Zotero

Programme

  • Rappels sur l’alimentation  de la base Zotero :  Utilisation d’identifiants bibliographiques, de PDF, importation de  fichiers
  • Faire une veille avec Zotero
  • Optimisation de la  base : gestion des mots clés, Recherche avancée et collections dynamiques
  • Extension des fonctions de Zotero avec quelques utilitaires
  • Sauvegarder ses références : dossier Zotero, export des références
  • Le compte en ligne : Synchronisation des données - travail collaboratif / bibliographie commune

La personnalisation des styles ne sera pas abordée en détail pendant cette séance. Elle fait l'objet d'un stage distinct.

Pré-requis

Cette séance permet à des personnes utilisant déjà régulièrement Zotero d'optimiser leur travail avec ce logiciel. Il est nécessaire de savoir utiliser les fonctions de base du logiciel (Importation de références, citation dans un traitement de texte) ou d'avoir suivi une formation d'initiation à Zotero

Intervenant: 

Noël Thiboud, responsable de l'URFIST de Strasbourg

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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news-9990 Thu, 07 Nov 2024 09:00:00 +0100 Formation à la contribution sur Wikipédia et Wikimédia /actualites/actualite/formation-a-la-contribution-sur-wikipedia-et-wikimedia-08-11-2024 Apprendre à contribuer à Wikipédia et participer à la vie de sa communauté

Venez apprendre à contribuer à Wikipédia et participer à la vie de sa communauté. Créer ou améliorer un article : c’est possible ! Guide avancé pour participer à l’amélioration de Wikipédia.

Cette formation nécessite certains prérequis de la formation générale à l'encyclopédie Wikipédia.

Programme

  • Créer son compte et rejoindre la communauté ;
  • Les critères d'admissibilité spécifiques ;
  • Page de brouillon, modèles et syntaxe ;
  • Ajouter des sources ;

Intervenant: 

Mickaël Schauli, wikimédien en résidence à l'URFIST de Strasbourg

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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news-9973 Tue, 05 Nov 2024 14:00:00 +0100 Illustrez la science /actualites/actualite/illustrez-la-science-05-11-2024 Partager ses photos et vidéos scientifiques sur Wikimedia Commons

Wikipédia est un environnement dédié à la collecte et au partage de contenu éducatif, librement accessible à toutes et à tous.

Cela en fait une excellente plate-forme pour la présentation de photos scientifiques.

Accès ouvert, gratuité et recherche de consensus ne sont que quelques-unes des caractéristiques de la plus grande encyclopédie au monde.

Cela en fait un environnement attrayant pour la vulgarisation de la science en général et de ses illustrations.

Wikipédia est reconnu pour sa diffusion des connaissances à grande échelle et les photos à visée scientifiques sont appréciées pour leur grande qualité informationnelle, cela rend la collaboration entre la communauté Wikimédia et les photographes scientifiques bénéfique pour ces deux publics.

Le concours Wiki Science Competition est donc un cadre motivant pour mettre en place une relation durable entre les deux.

À la fin de la séance, les participants seront en mesure :

  • de naviguer dans la médiathèque
  • de verser sur Wikimedia Commons des fichiers (photos, vidéos, scans, etc.)
  • comprendre les enjeux juridiques liés à ces dépôts
  • d'insérer des contenus de Wikimedia Commons dans Wikipédia

Une 2e formation dédiée aux techniques avancées d'import de fichiers est organisée deux jours plus tard

Intervenant: 

Pierre-Yves Baudoin, wikimédien en résidence à l'URFIST de Bordeaux

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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news-9985 Tue, 05 Nov 2024 12:00:00 +0100 Atelier Click & Read /actualites/actualite/atelier-click-read-05-11-2024 Accédez en un clic aux publications signalées sur une page web

Cette formation permet de découvrir Click & Read, une extension de navigateur réalisée par l'Inist-CNRS qui permet d'accéder en un clic aux publications signalées sur une page web lorsqu’un identifiant documentaire (DOI, PMID, PII) y est mentionné et que votre bibliothèque possède la ressource.

Programme

  • Présentation de Click&Read
  • Installation et paramétrage de l’extension et recherches documentaires

Intervenante: 

Martine Busché, bibliothécaire en charge des ressources électroniques, pôle Appui à la diffusion de la recherche, Service des bibliothèques, Université de Strasbourg

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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news-9972 Tue, 29 Oct 2024 13:00:00 +0100 WikiCafé /actualites/actualite/wikicafe-29-10-2024 Découvrez les actions menées par d'autres services ou d’autres universités, des outils et des actualités en lien avec Wikipédia en France

 

Personnels techniques, de soutien à la recherche, enseignants-chercheurs et doctorants de toute la France intéressés par les projets Wikimédia (Wikipédia, Wikidata, Wikimedia Commons, etc) et leurs liens avec la recherche sont invités à se retrouver en ligne un mardi par mois entre 13h et 14h. Les WikiCafés sont l'occasion de découvrir les actions menées par d'autres services ou d’autres universités, des outils et des actualités. Ces rendez-vous informels sont aussi l'occasion de poser des questions et d'échanger sur vos projets éventuels mobilisant Wikimédia.

Les WikiCafés sont animés par les wikimédiens en résidence au sein du Réseau des Urfist:

  • Pierre-Yves BEAUDOUIN
  • Mickaël SCHAULI
  • Delphine MONTAGNE

Événement sans inscription : https://zoom.us/j/5565148580?pwd=VlBwN2JhYTdwM2RjU0hrUWl5T3FyUT09

Intervenant:

Littérature et humanités numériques : la recherche avec le projet Wikisource, par Philippe Gambette

Langue/Language: le rendez-vous aura lieu en français.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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Agenda des formations Science ouverte
news-9971 Thu, 24 Oct 2024 10:00:00 +0200 Formation générale à l'encyclopédie Wikipédia /actualites/actualite/formation-generale-encyclopedie-wikipedia-24-10-2024 Comment sont ajoutés les articles dans Wikipédia? Qui s’en occupe?

Venez découvrir le fonctionnement de Wikipédia et des autres projets Wikimédia dans un atelier ouvert à tous et sans prérequis. Comment sont ajoutés les articles ? Qui s’en occupe ?

Programme:

Découvrez le fonctionnement de Wikipédia, du mouvement Wikimédia et découvrez quelques autres projets liés directement à l'encyclopédie en ligne.

  • Les projets Wikimédia : lesquels et pourquoi ?
  • Critères d'admissibilité des articles et principes fondateurs
  • Organisation de la communauté

Formation avec petits ateliers pratiques. Sans prérequis. Merci d'apporter votre propre ordinateur.

Intervenant: 

Mickaël Schauli, wikimédien en résidence à l'URFIST de Strasbourg

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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news-9970 Tue, 22 Oct 2024 13:00:00 +0200 Atelier Zotero /actualites/actualite/atelier-zotero-les-nouveautes-de-la-version-22-10-2024 Les nouveautés de la version 7

Vous avez déjà installé Zotero mais vous rencontrez des difficultés lors de son utilsation ? Perfectionnez votre pratique de Zotero et optimisez son usage pour gagner en  temps et en efficacité. Cet atelier vous permettra de découvrir les nouveautés de la version 7 et  d'échanger avec les autres participants.

Programme:

  1. Présentation de Zotero 7 et de ses nouveautés
  2. Autres points selon les questions posées au moment de l’inscription à la session. Ce stage n’est pas une initiation à Zotero. Le contenu sera établi en fonction des questions posées par les  participants lors de l’inscription.

Exemples de thèmes possibles

  • La récupération des données bibliographiques dans Zotero
  • Organiser sa base Zotero : les bonnes pratiques
  • Produire une bibliographie correctement présentée

Prérequis:

Cette formation suppose une pratique regulière du logiciel. Il est nécessaire de poser au moins une question pour valider votre inscription à la session.

Venir avec son ordinateur personnel et sa base Zotero

Intervenant: 

Noël Thiboud, responsable de l'URFIST de Strasbourg

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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Agenda des formations Science ouverte
news-9969 Mon, 21 Oct 2024 09:30:00 +0200 Introduction aux données de la recherche /actualites/actualite/introduction-aux-donnees-de-la-recherche-21-10-2024 Comment gérer ses données de recherche?

Objectifs

  • Comprendre les principes et les enjeux liés à la gestion et à la diffusion des données de la recherche
  • Connaître des ressources et des services susceptibles de vous aider dans la gestion des données

Programme

  • Gérer les données : principes et bonnes pratiques
  • Panorama d'outils et de ressources : plan de gestion de données, entrepôts de données, services d'appui à la recherche  etc.
  • Enjeux et débats autour  des données de la recherche

Prérequis:

Aucun. Avoir suivi un module d'Introduction à la science ouverte est un plus mais n'est pas obligatoire

Intervenant: 

Noël Thiboud, responsable de l'URFIST de Strasbourg

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

L'inscription est obligatoire via le site des URFIST.

Contact: urfist[at]unistra.fr

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news-9917 Thu, 17 Oct 2024 09:00:00 +0200 Éditathon : les revues sur Wikipédia /actualites/actualite/editathon-les-revues-sur-wikipedia-17-10-2024 Quelle place pour vos revues ou travaux scientifiques sur Wikipédia ? Vous êtes membre de l’équipe éditoriale d’une revue du site universitaire alsacien et souhaitez apprendre comment utiliser Wikipédia pour la valoriser ?

La matinée sera consacrée à une présentation théorique des approches possibles et des critères d’admissibilité sur Wikipédia et de son fonctionnement.

Elle sera suivie d’un atelier, où vous serez amenés à ajouter / mettre à jour des références voire des visuels sur l’encyclopédie libre, dans une démarche de valorisation de vos revues.

À l’issue de la journée, vous recevrez un résultat statistique chiffré des modifications globales apportées à l’encyclopédie.

Objectifs :

  • Connaître et être en mesure d’implémenter les stratégies de valorisation d’une revue scientifique en utilisant Wikipédia
  • Apprendre à utiliser des revues (en l’occurrence celles de l’Université de Strasbourg) comme sources pour améliorer un article Wikipédia ;
  • Savoir mettre en forme les références sur Wikipédia pour former une bibliographie ;
  • Savoir insérer une image dans un article Wikipédia, en l’important sur Wikimedia Commons puis en l’ajoutant dans l’encyclopédie.
  • Se sensibiliser au fonctionnement de Wikipédia et intégrer les bonnes pratiques de l’encyclopédie et de sa communauté.

Intervenant : Mickaël Schauli, Wikimédien en résidence à l’Urfist de Strasbourg. Cette formation est organisée avec le soutien de l’Ouvroir, dans le cadre de l’Open access month.

Public : Enseignants-chercheurs de l’université de Strasbourg et de l’université de Haute-Alsace, membres d’une revue scientifique du site universitaire alsacien.

Prérequis : Avoir créé un compte Wikipédia. Un mémo vous sera envoyé en amont de la formation.

Inscription gratuite mais obligatoire.

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news-9623 Wed, 16 Oct 2024 11:02:00 +0200 Python /actualites/actualite/python-16-10-2024 Utiliser le langage de programmation Python

Public:

Personnel de l'Université de Strasbourg et des établissements partenaires (contrat de site alsacien: UHA, INSA, BNU, ENSAS, ENGEES et Hear), confronté à l’utilisation d’un langage de programmation, désirant s’initier plus particulièrement au langage Python.

Prérequis:

La connaissance préalable d’un langage de programmation facilitera l’apprentissage mais n’est pas obligatoire. Les participants devront venir avec un PC portable pouvant se connecter au wifi. Il serait fort appréciable d’avoir au préalable installé Python, Jupyter Notebook et l’environnement de développement Spyder afin de rentrer directement dans le vif du sujet.


Objectifs:

  • Être capable de créer et manipuler des données, de gérer la logique de programmation.

Contenu:
Lors de cette formation initiale sur deux jours, nous aborderons les fondamentaux du langage :

  1. variable
  2. type de données
  3. opérateurs
  4. structures de contrôles
  5. fonctions
  6. bonnes pratiques de développement

Les connaissances acquises seront appliquées dans le cadre d’un microprojet.

 

Intervenante: Mary Mondino (ICube)

Inscription: gratuite pour les personnels concernés, sur inscription obligatoire via le service formation des personnels de votre établissement.

Contact: DRH-formation[at]unistra.fr

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news-9908 Tue, 15 Oct 2024 09:00:00 +0200 Rencontre sur les logiciels de recherche /actualites/actualite/rencontre-sur-les-logiciels-de-recherche-15-10-2024 Vous développez un logiciel en open-source à des fins de recherche? Venez échanger et participer au rendez-vous sur les logiciels libres de recherche Participez à la cinquième rencontre sur les logiciels libres de recherche

 

De nombreux personnels de recherche développent des logiciels au sein de leurs laboratoires et unités de recherche à l'Université de Strasbourg et au sein des unités mixtes (CNRS).

Voici un rendez-vous pour échanger et se connaître.

Les intervenants de la rencontre sont:

  • Vincent Chabannes (IRMA/ CEMOSIS)
  • Lauriane Kuhn (IPHC)
  • Matthias Zdravkovic (IPHC)
  • Jérôme Pansanel (IPHC)
  • Sébastien Le Roux (IPCMS)

9h-9h30: Accueil café
9h30: Les métadonnées pour les logiciels par Jérôme Pansanel (IPHC)
10h: Feel ++: une librairie open source par Vincent Chabannes (IRMA/ CEMOSIS)
10h30: Cybade : un logiciel pour la gestion d'animalerie par Lauriane Kuhn (IPHC)
11h00: Interfaçage de bases de données avec Symfony par Matthias Zdravkovic (IPHC)

L'après-midi sera consacré à des ateliers, qui se tiendront en salle Mondrian, bâtiment 25 sur le campus de Cronenbourg

13h30-14h30 : Comment renseigner les métadonnées de son logiciel avec CodeMeta
14h30-15h30:  Ateliers pour encourager l'utilisation de logiciels: Atomes par Sébastien Le Roux (IPCMS)
 

Pour des raisons de logistique, nous vous encourageons à confirmer votre participation via ce sondage.

Pour diffusion: affiche

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news-9911 Mon, 14 Oct 2024 10:00:00 +0200 Le temps des données 2/2: données environnementales /actualites/actualite/donnees-environnementales Participez aux rencontres sur les données environnementales qui explore leur traitement spécifique et les services qui existent aux niveaux local, national et international Venez découvrir le traitement des données environnementales à des fins de recherche, de leur collecte à leur partage. Les interventions s'adressent à toute chercheuse ou doctorante et à tout chercheur ou doctorant susceptible d'exploiter des données environnementales dans le cadre de ses recherches.

Les chercheuses et chercheurs sont producteurs de données géolocalisées et souvent à la recherche de données de recherche, pour faire des croisements disciplinaires: sciences humaines et sociales, sciences de l'environnement. La présente rencontre a pour but de livrer des clés d'entrée et des conseils d'utilisation sur des aspects liés au dépôt à la recherche de données de recherche. À partir de cas concrets, ce sera l'occasion d'explorer les différents entrepôts thématiques ou disciplinaires, ainsi que les ressources disponibles à Strasbourg.

Intervenants:

  • Anne Puissant, directrice du pôle Theia au sein de l'infrastructure de recherche Data Terra
  • Loup Bernard et Mohamed Benkhalid, membres du consortium Huma-Num pour l'archéologie, ArkéoGis

Pas d'inscription préalable.

La participation en présentiel des doctorants, sur signature de la liste d'émargement, fera l'objet de crédits de formation transversale.

Les interventions seront diffusées en direct et enregistrées via la chaîne Youtube de la MISHA.

Un  buffet sera proposé de 12h à 13h dans le hall de la MISHA pour échanger et interagir entre participants et intervenants.

Pour diffusion: affiche

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Agenda Science ouverte
news-9916 Thu, 10 Oct 2024 10:30:00 +0200 Introduction aux Jupyter Notebooks dans le cadre de la science ouverte /actualites/actualite/introduction-aux-jupyter-notebooks-10-10-2024 Prise en main d'un outil pour documenter la production de vos données, codes et logiciels de recherche Rejoignez-nous pour une introduction pratique aux Jupyter Notebooks, outils puissants pour la science ouverte et l'analyse de données.

Au cours de cet atelier d'une heure et demie, nous explorerons comment les Notebooks facilitent la documentation, la collaboration et la reproduction de travaux. Nous aborderons également les bases de Python, le langage de programmation souvent utilisé avec ces notebooks. Que vous soyez novice en programmation ou simplement curieux-se de découvrir comment ces outils peuvent transformer votre approche de la recherche, cet atelier est fait pour vous !

Intervenante: Elisa Michelet, lab manageuse du lab de la Bibliothèque Nationale Universitaire de Strasbourg

Pas d'inscription préalable.

Contact: lab[at]bnu.fr

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Agenda Science ouverte
news-9974 Tue, 08 Oct 2024 14:00:00 +0200 Déposer un jeu de données /actualites/actualite/deposer-un-jeu-de-donnees-08-10-2024 Participez aux classes virtuelles de Recherche Data Gouv Cette classe virtuelle permet de comprendre comment déposer un jeu de données dans l’entrepôt. Cette séance aborde les points suivants :

  • Présentation de Recherche Data Gouv
  • Concepts clés
  • Utilisation de l’entrepôt

Public : toute personne pouvant être amenée à utiliser l’entrepôt Recherche Data Gouv.

Support : Déposer des données dans l'entrepôt Recherche Data Gouv

Intervenants:

Equipe plateforme Recherche Data Gouv

Rappel : il n'est pas nécessaire de s'inscrire, il suffit de rejoindre la session souhaitée en temps et en heure en cliquant sur le lien suivant : https://bbb.visio.inrae.fr/b/cla-iui-rpi-mtg

Contact: en local à l'Université de Strasbourg: Recherche Data Gouv:

support-entrepot[at]unistra.fr

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Agenda des formations Science ouverte
news-9906 Mon, 07 Oct 2024 11:00:00 +0200 Le temps des données 1/2: publier ses données de recherche /actualites/actualite/le-temps-des-donnees-publier-des-donnees-de-recherche Participez aux rencontres sur les données en sciences sociales qui explore la valorisation des données de recherche et les modalités de publication des données de recherche Venez découvrir les nombreuses modalités pour diffuser, publier et valoriser ses données de recherche: entrepôts de données, plateformes structurées, Wikidata, et plus loin les nouveaux types de publications liés à la diffusion ouverte des données de recherche: data descriptors, data papers et journaux dédiés aux data papers, les data journals.

Intervenants:

  • Stéphanie Cheviron, data librarian de l'Université de Strasbourg et coordinatrice de l'atelier de la donnée ADELE Helpdesk
  • Mickaël Schauli, wikimédien en résidence à l'Université de Strasbourg
  • Julien Gossa, enseignant chercheur au sein du laboratoire SAGE (UMR 7363) et contributeur Wikidata pour le projet WikidataESR (https://github.com/cpesr/WikidataESR): WikidataESR est un projet d'exploitation et de modification des données wikidata modélisant le système d'enseignement supérieur et de recherche français, notamment pour l'élaboration de tableaux de bord des établissement (https://cpesr.fr/tableau-de-bord-esr/). La présentation s'attachera à démontrer la réussite technique du projet, et à analyser les causes de l'échec de son adoption.
  • Abel François, enseignant chercheur au sein de Sciences Po Strasbourg, l'EM Strasbourg et le laboratoire LaRGE (UR 2364): Cette intervention sera l'occasion de présenter la nouvelle revue électronique en libre acces DEMC qui publie des articles courts portant sur la présentation de données, d'expériences, de méthode d'exploitation de matériel empirique et de code informatique dans les domaines des sciences sociales. Abel François est membre du comité éditorial de DEMC.

Pas d'inscription préalable.

La participation en présentiel des doctorants, sur signature de la liste d'émargement, fera l'objet de crédits de formation transversale.

Les interventions seront diffusées en direct et enregistrées via la chaîne Youtube de la MISHA.

Un  buffet sera proposé de 12h30 à 13h dans le hall de la MISHA pour échanger et interagir entre participants et intervenants.

Pour diffusion: affiche

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news-9898 Thu, 03 Oct 2024 10:00:00 +0200 Créer un baromètre science ouverte pour son unité de recherche /actualites/actualite/atelier-barometre-science-ouverte-03-10-2024 Participez à un atelier pratique autour des baromètres science ouverte mesurant les taux de publications en open access aux niveaux nationaux et locaux

Cet atelier vise à:


Seront abordés les points suivants:

  1. sources utilisées et leur interrogation
  2. pas à pas pour créer son baromètre (à partir du dépôt git)


Intervenants : Georges Gressot, chargé de traitement des données scientifiques et statistiques & Héloïse Gazeau, responsable de l'équipe publications scientifiques (pôle Appui à la diffusion de la recherche, service des bibliothèques, Université de Strasbourg)

Inscription: Inscription préalable via cet Evento. Nombre de places limité à 20 personnes.

Public visé: doctorants et personnels des universités et des organismes de recherche

Langue/Language: la présente formation aura lieu en français.

Contact: openaccessmonth[at]unistra.fr

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Agenda Science ouverte
news-9895 Mon, 30 Sep 2024 13:00:00 +0200 Data Coffee /actualites/actualite/data-coffee-30-09-2024 Rémy Decoupes (UMR TETIS) présente son analyse sur l'impact des data papers Les Data Coffees sont l'occasion de découvrir ce que font d'autres services en terme de formations, d'évènements scientifiques et de services liés aux données de recherche. C'est un rendez-vous informel, l'occasion de se rencontrer en dehors des réunions de travail.


Pour le présent rendez-vous Data Coffee, nous avons la chance d'accueillir Rémy Decoupes, ingénieur de recherche, travaillant au sein de l'UMR Tetis (INRAE), à Montpellier.

Rémy Decoupes collabore directement avec le laboratoire ICube, dans le cadre du projet ANR Herelles.

 

Une des bonnes pratiques de la science ouverte recommande fortement le dépôt des données dans des entrepôts en ligne. Lors du dépôt, le travail de saisie des métadonnées est parfois fastidieux, alors que le nombre de consultations et de téléchargements des données publiées dans ce cadre est souvent très faible par rapport au temps investi.
Il existe différentes méthodes pour augmenter la visibilité des données afin de favoriser leur réutilisation et leur citation. Dans cette présentation, nous nous focalisons sur l'impact des data papers sur le gain en visibilité des données qu'ils décrivent.

Ce travail, centré sur l'UMR TETIS pour l'HCÉRES, est reproductible. Sous forme de notebook Quarto (équivalent à Rmarkdown), l'analyse récupère automatiquement ses informations via les différentes API de Recherche Data Gouv et de HAL afin de comparer le nombre de téléchargement des données avec ou sans data paper.

Lien vers l'étude :  Rémy Decoupes. Analyse de l'impact des data papers de l'UMR TETIS. UMR TETIS, 500 rue Jean-François Breton, 34000 Montpellier. 2024. ⟨hal-04428092v2⟩

 

Pas d'inscription préalable.

Rendez-vous assuré en mode hybride: ouverture de la salle virtuelle à partir de 13h: https://bbb.unistra.fr/b/cob-hp3-ntq-ynw

Modération: Noémi Cobolet, chargée de mission science ouverte (Service des bibliothèques, Université de Strasbourg): cobolet[at]unistra.fr

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Agenda Science ouverte
news-9896 Mon, 23 Sep 2024 14:00:00 +0200 Données & logiciels de recherche: quelle actualité à la Research Data Alliance? /actualites/actualite/rencontrez-les-membres-de-la-research-data-alliance-23-09-2024 Venez échanger avec les personnels impliqués dans l'organisation internationale Research Data Alliance

La Research Data Alliance (RDA) est une organisation internationale qui oeuvre en faveur du partage des données scientifiques et produit de nombreuses recommandations dans tous les domaines, de manière collective. Depuis 2018, l'Université de Strasbourg est membre affiliée de la Research Data Alliance.

Afin de mieux faire connaître la Research Data Alliance et les produits en cours au sein des groupes thématiques, plusieurs personnels de l'Université ont décidé de créer un groupe Research Data Alliance de l'Université de Strasbourg.


Vous êtes conviés à participer à la rencontre du groupe lundi 23 septembre 2024, de 14h à 15h, en ligne via BBB: https://bbb.unistra.fr/b/cob-zhz-tf8-uh5

Françoise Genova, représentante de l'Université de Strasbourg au sein de l'Organisational advisory board de la Research Data Alliance présentera l'organisation de la Research Data Alliance.

Avec Aline Grand, Françoise Genova commentera le programme des journées Research Data Alliance au niveau français, du 4 au 11 octobre 2024.

Sera également abordé l'inscription à la prochaine rencontre de l'organisation internationale 23ème Séance plénière du 12 au 14 novembre 2024 au Costa Rica et en ligne.


Organisatrices:

François Genova, directrice émérite à l'Observatoire Astronomique de Strasbourg et coresponsable du noeud national RDA France

Aline Grand, administratrice des données de recherche de l'Université de Strasbourg

Contact: scienceouverte-rda-request[at]unistra.fr

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Agenda Science ouverte
news-9648 Thu, 12 Sep 2024 15:05:00 +0200 Summer school | Advanced tools for data analysis in neuroscience /actualites/actualite/summer-school-advanced-tools-for-data-analysis-in-neuroscience Research discoveries are increasingly dependent on the development of new tools and technologies, as well as on the ability to process, manage and analyze the large amounts of data collected with these tools. Advanced tools for data analysis in neuroscience

Research discoveries are increasingly dependent on the development of new tools and technologies, as well as on the ability to process, manage and analyze the large amounts of data collected with these tools.

In this summer school, we will focus on several aspects of data preparation and analysis, as well as on the use of simulation and modeling tools capable of generating predictions. These tools will be applied to different data acquisition techniques such as electrophysiological recordings, fluorescence imaging or image series from human brain imaging.

There is no registration fees. Accommodation and lunches are also provided with no fees.

Travel is not covered.  

Target audience

Master and PhD students from the University of Strasbourg, French and European universities (including non EU).

Priority will be given to students enrolled in a basic or medical neuroscience program, but students from other specialties will be able to participate as long as places are available. 

Pre-school: Introduction to Python programming (Only for beginners)

FENS and IBRO-PERC provide 4 stipends of 750 EUR for Master and/or PhD students based in Europe interested in attending this course. Through these stipends FENS and IBRO-PERC aim to encourage and promote international experience of students; hence, students that are currently residing or studying in France are not eligible for a FENS and IBRO-PERC stipend for this course.

How to apply

Inquiry : philippe.isope at unistra.fr

Application deadline: May 1st, 2024.

Programme

PRESCHOOL

Thursday-Friday Sept 12th – Sept 13th.

  • 9-12:30; lunch; 2-6 PM

Introduction to Python programming: Conda environment, Python basics (Object, Types, list, arrays, loops, conditions, functions, classes), Python packages (e.g. Numpy, Pandas, Matplotlib…), Python with AI.

SCHOOL

Monday Sept 16th

  • 8:30 AM: Welcome and course presentation
  • 9 - 12:30 AM: Fundamentals of spectral analysis 
  • 2 - 4 PM: Oscillations analyses - from the raw data to the characterization of oscillatory activity
  • 4:30 - 6 PM: What to do when you have to estimate a function? Non-parametric    regression techniques

Tuesday Sept 17th

  • 9 - 12:30 AM: Machine learning for dummies
  • 2 - 3:30 PM: Times series analysis, spike train statistics
  • 3:45 - 5 PM: Hands-on analyzing calcium imaging data
  • 5:30 - 7 PM: Introduction to AI in data analysis for neurosciences

Wednesday Sept 18th

  • 9-11 AM: Network tools, functional connectivity analyses graph theory
  • 11:30-12:30 PM: Neuronal circuits modelling microscale Part I
  • 2 - 4 PM: Neuronal circuits modelling microscale Part II
  • 4 - 6 PM Automated algorithms for movement analysis
  • 8-10 PM: Project selection, discussion

Thursday Sept 19th

  • 9 - 12:30 AM: Neuronal circuits modelling: macroscale
  • 2 - 8 PM:  Projects
  • Social evening at “la Petite France”

Friday Sept 20th

  • 9 - 12:30 AM: Projects
  • 2 - 6 PM: Projects
  • 7 - 8 PM: Reproducible science/Open Science

Saturday Sept 21th

  • 9 - 12 AM: Project presentations and debriefing

 

Faculty

  • Claire Wyart, CNRS, INSERM, Paris Brain Institute, Paris, France
  • Jyotika Bahuguna, University of Strasbourg, France
  • Pascale Quilichini, INSERM, Aix-Marseille University, France
  • Demian Battaglia, USIAS, University of Strasbourg, France
  • Romain Goutagny, CNRS, University of Strasbourg, France
  • Axel Hutt, INRIA, Strasbourg, France
  • Philippe Isope, CNRS, University of Strasbourg, France
  • Arvind Kumar, KTH Royal Institute of Technology, Stockholm, Sweden
  • Christophe Pouzat, IRMA, University of Strasbourg, France                   
  • Antoine Valera, CNRS, University of Strasbourg, France
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Agenda des formations Science ouverte
news-9649 Mon, 15 Jul 2024 15:40:00 +0200 Surgical Data Science Summer School /actualites/actualite/surgical-data-science-summer-school The SDS summer school aims to promote research and innovation on computer/data science tools of clinical value by providing multidisciplinary education on surgical data science. The school is therefore dedicated to educating clinicians and computer scientists on respective contexts, needs, tools and methodologies. Background

We are witnessing the transformation of operating rooms into smart hubs of interconnected advanced technologies where multiple, highly specialized professionals must coordinate for the benefit of patients. Such high-stake sociotechnical process is generally highly effective but error prone. Surgical data science aims to improve the safety and efficiency of modern surgery by modelling multimodal surgical data and developing artificial intelligence (AI) algorithms to provide timely assistance to caregivers.

However, to build clinically impactful surgical data science tools there is a need for a tight and effective collaboration between clinicians and computer scientists. Currently, there is a lack of opportunities for these community to meet, learn from each other and finally develop the common language needed to team up and complement each other.

SDS Summer School

Educational materials  on fundamentals of image-guided surgery and computer/data science is freely accessible on our dedicated online SDS portal. Upon completing these fundamentals, prospective participants will be able to apply to an onsite selective multi-day intensive summer school consisting of a series of lectures and hands-on labs. During the on-site school participants will get the unique opportunity to work in small teams on practical projects with mentors’ help. Towards this, related materials (datasets and trained models) and resources (accelerators) will be provided, and the teams will be challenged to come up with novel ideas and data science solutions of clinical value.

The 2024 edition of the Surgical Data Science (SDS) Summer School will be jointly organised by the University of Strasbourg and the Institute of Image-Guided Surgery (IHU Strasbourg). The center offers a truly multidisciplinary environment to innovate in the image-guided surgery domain with strong collaborations with academia and industry. Surgeons and engineers work closely together on practical as well as moonshot research ideas. Promising ideas are funded and supported by internal and competitive research grants or by partnership programs, while developed and validated ideas are translated to products through licensing and startup spin-offs.

Who should consider applying?

Applicants for the onsite course should be:

  • Medical students in their last year
  • Physicians in residency, master or PhD
  • Computer scientists/engineers at a master, doctoral or postdoctoral level

Application process

Applicants need to do the following steps:

  • Register on the EVE platform
  • Complete the lectures on the EVE platform
  • Apply to the SDS summer school

Prospective students will be notified via email by 25th of May 2024 to complete registration.

Registration fees

  • 300€ for students (e.g. medical, computer science, PhD student)

Registration cost covers summer school educational activities, breakfast, lunch, and welcome dinner. Upon receipt of motivation letter a small number of complimentary registrations for participants from under-resourced areas will be offered.

Important dates

  • Launch of online lectures & opening of applications: 1st of January 2024
  • Application deadline: 15th of April 2024
  • Notification of decision: 15thof May 2024
  • Registration deadline: 31st of May 2024
  • SDS Summer School at IHU-Strasbourg: 15th – 19nd of July 2024

Organizers

Pietro Mascagni, MD

Researcher, IHU Strasbourg

Vinkle Srivastav, PhD

Research Scientist, IHU Strasbourg

Agnès Gronfier

Educational Program Manager, IHU Strasbourg

Justine Chadefaux

Education Program Coordinator, IHU Strasbourg

Silvana Perretta, MD

Professor of Surgery, Director of Education, IHU Strasbourg

Nicolas Padoy, PhD

Professor, University of Strasbourg, Director of AI Research, IHU Strasbourg

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Agenda des formations Science ouverte
news-9686 Tue, 09 Jul 2024 14:00:00 +0200 Permanence du pôle Calculs et Services avancés à la recherche /actualites/actualite/permanence-du-pole-calculs-et-services-avances-a-la-recherche-09-07-2024 Le pôle CESAR de la direction du numérique propose l'atelier de CESAR

Vous vous intéressez aux évolutions du numérique et plus particulièrement à ses impacts sur la société, sur nos modes de consommation ou encore sur l'environnement ? Vous souhaitez débattre de ces questions, partager votre expérience, ou encore le fruit de vos recherches ?

Rejoignez l'atelier de CESAR et contribuez, chaque semaine, à l'évolution des pratiques numériques, dans une approche collaborative, éthique et vertueuse. Au programme, entre autres sujets :

  • discussions et réalisations autour de l'approche convivialiste du développement web
  • comparaison de solutions de génération de sites web
  • data challenges (basés sur des outils de la logithèque Unix)
  • amélioration de code (tests, factorisation, packaging)

 

Public
Tout public

Animation
Pôle Calcul et Services Avancés à la Recherche (CESAR) - DNum - Université de Strasbourg

Inscription obligatoire via ce formulaire mais vous pouvez venir à tout moment entre 14h et 19h

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