Du 12 au 14 février 2024, le développement des logiciels de recherche et le travail des développeurs au sein des unités de recherche de l'Université de Strasbourg ont été mis à l'honneur.
Lundi 12 février de 13h à 14h: rendez-vous Data Coffee
avec Valérie Cognat (IBMP) sur la plateforme Bioinformatique
Pour le présent rendez-vous Data Coffee, nous avons la chance d'accueillir Valérie Cognat, ingénieure de recherche en charge de la plateforme Bioinformatique et rattachée à l'Institut de biologie moléculaire des plantes (IBMP).
Valérie Cognat nous présentera la plateforme, les services proposés aux chercheurs et notamment les formations qui sont montés à destination des doctorants et des chercheurs de bioinformatique:
www.ibmp.cnrs.fr/bioinformatics-trainings/
Consultez la présentation de Valérie Cognat.
Pour en savoir plus sur les rendez-vous Data Coffee.
Mardi 13 février de 14h à 16h: rencontrez les personnels investis dans la Research Data Alliance
avec Françoise Genova (CDS), Jérôme Pansanel (IPHC) et Aline Grand (SBU)
L'Université est une organisation membre de la Research Data Alliance.
Pour en savoir plus sur le groupe Research Data Alliance de l'Université de Strasbourg.
Mercredi 14 février de 9h à 15h30: Research Software Day
avec Lennart Martens (UGhent, Chaire Gutenberg à l'IPHC), Teresa Gomez Diaz (Université Gustave Eiffel), Manon Marchand, Matthieu Baumann (CDS) et Jérôme Pansanel (IPHC)
A software developer and a data scientist, in an open science world
Lennart Martens
University of Ghent, Chaire Gutenberg
lennart.martens[at]UGent.be
These days, programming skills are increasingly useful (if not outright essential) when dealing with substantial amounts of data. As a result, more and more researchers become part-time sofwtare developers, or data scientists, or both. Some enterprising individuals even go all the way, and transition to the keyboard full-time. But all of this is not without its challenges, especially not in an increasingly open science context. Here, we will look at a few relevant aspects, including software development best practices, some useful tools and resources, expectation management, and the dreaded curse of building the actually useful tool.
Consultez la présentation en ligne de Lennart Martens.
Author's rights (in France) and licenses for your Research Software
Teresa Gomez-Diaz
CNRS/LIGM and Université Gustave Eiffel
teresa.gomez-diaz@univ-eiffel.fr
The activities regularly carried out within the framework of research laboratories, in France and abroad, increasingly include software development. These software are frequently developed using forges and are freely accessible there, or they are distributed on personal web pages, laboratory pages, projects, etc.
This software is essential in obtaining scientific results and a key element in their reproducibility.
However, making Research Software visible and accessible requires that it is distributed correctly, within a controlled legal framework, with a license that allows its use, modification and redistribution. But who decides on this license? When should it be put into place? Who are the rights holders of this work? What licenses should be used and under what conditions?
In this presentation we will study the production context of Research Software and the legal questions that arise regarding copyright and licenses [1]. We will propose a diffusion procedure whose steps take these questions into account [2].
We will review the concept of Research Software [1,3] and also propose the CDUR protocol for its evaluation as a scientific production [3] within the framework of Open Science [4].
This work benefits from the experience at the Gaspard-Monge Computer Science Laboratory (LIGM) [5], the PLUME Project (2006-2013) [6] and the work in collaboration with Prof. Tomas Recio (Univ. Nebrija, Madrid) [3,4].
References
[1] Article vs. Logiciel : questions juridiques et de politique scientifique dans la production de logiciels
T. Gomez-Diaz (2015), https://zenodo.org/record/18993
[2] Diffuser un logiciel de laboratoire : recommandations juridiques et administratives
T. Gomez-Diaz (2010), https://zenodo.org/record/7096216
[3] On the evaluation of research software: the CDUR procedure, F1000Research 2019, 8:1353
T. Gomez-Diaz, T. Recio (2019),
https://doi.org/10.12688/f1000research.19994.2
[4] Towards an Open Science definition as a political and legal framework: on the sharing and dissemination of research outputs
T. Gomez-Diaz, T. Recio (2020-21),
(V3, février 2021) https://zenodo.org/record/4577066
(v2, décembre 2020) Publication POLIS, https://doi.org/10.58944/yuro5734
[5] Sur la production de logiciels libres au Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge (LIGM) : ce que nous avons appris
T. Gomez-Diaz (2021),
https://github.com/blue-hats/ateliers/blob/main/details/2021-04-09.org
http://igm.univ-mlv.fr/~teresa/logicielsLIGM/documents/Seminaires/2021avrilBlueHats_TGD.pdf
[6] Thème PLUME Patrimoine logiciel d'un laboratoire
T. Gomez-Diaz (2009-2013),
https://zenodo.org/communities/plume-patrimoine-logiciel-laboratoire/
Consultez la présentation en ligne de Teresa Gomez Diaz.
Rencontre sur les logiciels de recherche:
Maintaining and contributing: open software for astrophysics
Manon Marchand & Matthieu Baumann
CDS/ CNRS and Université de Strasbourg
https://astro.unistra.fr/fr/recherche/cds/
The participation to open software of the Strasbourg Astronomical Data Center (CDS) is twofold: we publish and maintain software, and we contribute to the existing ecosystem of astronomical libraries. In this short intervention, we'll present the libraries of our public forge https://github.com/cds-astro and discuss our interactions -- as contributors and as maintainers -- with the rest of the astronomical developing community.
Consultez la présentation en ligne.
The Second National Roadmap for Open Science and Research Software
Jérôme Pansanel
IPHC/CNRS and Université of Strasbourg
After an introduction to the national roadmap for Open Science, its section dedicated to research software will be presented. The presentation of a concrete case will then provide an example of how these recommendations can be applied. Finally, the local application of the roadmap will be detailed.
Consultez la présentation en ligne.
Pour en savoir plus sur les rencontres des logiciels libres de recherche.